Op basis van onderzoek kunnen betere keuzes gemaakt worden voor het natuurbeheer en de natuurontwikkeling. De afgelopen jaren is een grootscheeps onderzoek uitgevoerd om de hydrologie in de natuurgebieden in kaart te brengen. Daarnaast is een studie gedaan naar de mogelijkheden voor het verhogen van de natuurwaarden door het ontwikkelen van overgangen van zoet naar zout water. Op basis van de uitkomsten van deze studies worden de komende jaren diverse natuurontwikkelingsprojecten uitgevoerd.
In het najaar van 2006 is een grootschalig muizenonderzoek uitgevoerd door de VZZ, de Nederlandse Vereniging voor Zoogdierkunde en Zoogdierbescherming. De resultaten daarvan waren in velerlei opzichten interessant. Zo werd er een zoogdiersoort gevonden die nog nooit eerder op het eiland was vastgesteld, de huisspitsmuis. Een van de redenen van het onderzoek was het vermoeden dat de aardmuis, ook pas aan het eind van de 20ste eeuw op het eiland geïntroduceerd, een geduchte concurrent is van de noordse woelmuis, waarvan op Texel een unieke ondersoort leeft. Door afwezigheid van concurrentie was de verspreiding van de noordse woelmuis groter dan in vergelijkbare gebieden op het vaste land. Nu de concurrentie is gearriveerd is het natuurlijk interessant om te weten of het leefgebied op het eiland nu ook wordt ingeperkt.
